Родился Николай Иванов в 1813 году.

Обучение его проходило в Павловском кадетском корпусе. В 1830 году он закончил учебу, став прапорщиком батарейной роты 10-й артиллерийской бригады.

Николай Агапович принимал участие в польской компании 1831 года. С 1837 года служил в Отдельном Кавказском корпусе. С тех самых пор он непрерывно принимал участие в походах против горцев. В 1849 году был начальником 7-го округа инженеров военных поселений на Кавказе.

В 1852 году Николай Иванов был произведен в полковники, назначен исправляющим должность Кутаисского гражданского губернатора.

Через 6 лет Николай Агапович получил чин генерал-майора и назначен помощником командующего войсками в Кубанской области. В 1861 году его назначают наказным атаманом Кубанского казачьего войска. В этой должности он принимал участие в завершающих кампаниях Кавказской войны.

С 1863 года Иванов без должности состоял при Кавказской армии, а уже в 1866 году был произведен в генерал-лейтенанты.

Не стало Николая Иванова 7 ноября 1873 года.

Среди прочих наград Николай Агапович Иванов имел ордена — польский знак отличия за военное достоинство 4-й степени, орден Святой Анны 3-й степени, орден Святого Владимира 4-й степени с бантом, золотая полусабля с надписью «За храбрость», орден Святого Георгия 4-й степени и другие почетные награды.